本港為提昇裝卸效率，業自中華民國88年1月1日起開放民營業者參與碼頭裝卸作業；目前港區有四家民營裝卸公司辦理港區裝卸作業，全年全方位提供您裝卸業務之資詢與服務。
| 公司名稱 | 地址 | 聯絡 | 公司相片 |
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| 花蓮港起卸(股)公司 | 花蓮市港口路23號 | 電話(03)8222206 傳真(03)8233563 |  |
| 良友倉儲(股)公司 | 花蓮市海岸3-6號 | 電話(03)8232233 傳真(03)8232211 |  |
| 東海岸裝卸(股)公司 | 花蓮市民權路90號 | 電話(03)8223912 傳真(03)8230551 taiship@ms27.hinet.net |  |
| 東逸裝卸(股)公司 | 花蓮市民樂三街6號 | 電話(03)8237979 傳真(03)8236678 |  |